集中深施用主要用于栽培森林、水果和一些根深蒂固的作物。种植树木时，树坑的深应比通常种植的深高20~30厘米。集中施用厚约30厘米的发酵羊粪，种植后用正常方法覆盖土壤浇水。追肥与底肥的配比为3:7。对普通农作物，每茬一百~两百KG蚯蚓肥粪;果树每亩两百~300KG，可适当减。

　　撒施将羊粪撒在植物附近土面上，使土表形成有益微生物层，可收到蓄水保墒效果，使地表植物根系发达，能够充分利用土表养分，对浅根性植物根系的生长尤为有利。多用于草坪，一般以蚯蚓肥粪1kg每均匀撒施在草坪表层即可。

　　叶面喷施利用羊粪对某些植物病害(主要是土传病害)的抑作用，来起到防和治病害的目的，适用于果树、花卉或染病的盆栽植物。蚯蚓粪应尽可能使用新鲜的，而且好是经过短期发的，发可使其中不够腐熟的粪料熟化，使有益微生物增殖更多，肥效也会更高。蚯蚓粪不宜保存过久，否则肥效会明显下降。

　　虽营养，但养分含量稍显不足，所以与无机肥配合使用效果更佳，但不宜与速溶性化肥掺混使用。此外，蚯蚓肥粪的土壤改良效果是比较慢的，如果土壤问题严重加以改良。

　发酵羊粪不宜暴晒，高温干燥，会降低微生物的性。因为蚯蚓肥粪含有大量的生物，所以不能和菌剂混合使用。蚯蚓肥粪中的悬浊液对疾的防和治效果不稳定。病情频发时，应使用物品，不得延误防和治。